Desfeita a Comissão de Limites, Irineu se muda para Rio Branco e passa a servir na Guarda Territorial, onde conheceu Germano Guilherme, que se tornou um grande amigo e seguidor. Nas horas de folga os dois se refugiavam nas matas para tomar ayahuasca. Irineu chegou a ser promovido a cabo, mas logo pediu baixa na carreira militar, para cumprir as ordens de sua guia espiritual Clara, que o convocara para exercer o comando espiritual da Doutrina da Floresta.